PARALIGN，提供查询相似序列的公共序列数据库的服务，在这里可以搜索基因关系、功能和结构等有价值的信息，网站采用常用的算法被称为Smith-Waterman算法，通过利用并行计算技术，PARALIGN网站已经取得比Smith-Waterman方法快8倍的运行速度。PARALIGN是由挪威科技大学（NTNU）和挪威生命科学大学（UMB）等研究机构合作开发的生物信息学工具，最初发布于2005年，主要用于核酸和蛋白质序列的局部比对。该工具通过对Smith-Waterman算法进行并行化优化，大幅提高了计算效率，使得大规模基因组序列比对成为可能。PARALIGN作为一个免费开放的公共生物信息学资源，为全球的研究人员提供了高效的序列比对服务，对生物信息学领域的发展做出了重要贡献。然而该网站目前已无法正常访问，域名处于停放状态。
PARALIGN官网
http://www.paralign.org/
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